消毒的剂量

消毒剂量是杀灭微生物的基本条件，它包括消毒强度和时间两方面。消毒强度在热力消毒时是指温度高低；在化学消毒时是指物浓度；在紫外线消毒时是指紫外线照射强度。一般来说，增加消毒处理强度能相应提高消毒（杀菌）的速度；而减少消毒作用时间也使消毒效果降低。当然，如果消毒强度降低至一定程度，即使再延长时间也达不到消毒目的。

微生物污染的种类和数量

生物的种类不同，对其消毒的效果自然不同。另外微生物的数量的多少也会影响消毒效果，所以在消毒前要考虑到微生物污染的种类和数量。一般来说，微生物的抵抗力越强、污染越严重、消毒就越困难。

温度的影响

除热力消毒完全依靠温度作用来杀灭微生物外，其他各种消毒方法亦都受温度变化的影响。一般来说，无论在物理消毒还是化消毒剂中，温度越高效果越好。关于温度变化对消毒效果的影响的程度，往往随消毒方法、药物及微生物种类不同而异，一般可温度系数来表示。
相对温度 消毒环境相对湿度对气体消毒和熏蒸消毒的影响的影响十分明显，温度过高或过低都会影响消毒效果，甚至导致消毒失败。室内空气甲醛熏蒸消毒的相对湿度应为80-90%，小型环氧乙烷消毒处理的相对湿度以40-60%为宜大型消毒（>0.15立方米）为 50%-80%。另外紫外线在相对湿度为60%以下杀菌力较强，在80%-90% 时杀菌力下降30%-40%，因为相对湿度增高回影响紫外线的穿透力。

酸碱度（PH值）

酸碱度的变化可直接影响某些消毒方法的效果。一方面是PH值对消毒剂本身的影响会降低或提高消毒剂的活性；另一方面是PH值对微生物的影响。如戊二醛在PH值由3升至8时，杀菌作用逐步增强；而次氯酸盐溶液PH值由3升至8时，杀菌作用却逐渐下降；洗必泰、季铵盐类化合物在碱性环境中杀菌作用较大。